No se cuenta con información sobre sus orígenes y tampoco sobre sus estudios musicales. Alrededor de los veinte años de edad viajó a Alemania, donde desarrolló su carrera musical.

Edición discográfica con obras de Cesare Bendinelli

Estuvo activo como trombonista en Schwerin desde 1562 hasta 1565. Desde 1567 estuvo en Viena y luego desde 1580 hasta su muerte fue el principal trompetista de la corte en Munich.

En 1614 presentó a la Accademia Filarmonica de Verona su primer método conocido para trompeta, "Tutta l´arte della trombetta", cuyo contenido recopiló de los mejores compositores de su época y obras escritas por él mismo. Su método es de importancia histórica porque contiene las primeras piezas fechadas en 1584, 1587 y 1588, para el registro clarino de la trompeta, y aclara la práctica del Renacimiento tardío de improvisar sobre una segunda parte o 'sonata' en un conjunto de cinco partes para trompeta.

También afirmaba haber sido el primero en aplicar sílabas linguales -una ayuda importante tanto para la articulación como para la colocación de registros- a la trompeta. También presentó a la academia su trompeta, hecha por Anton Schnitzer en 1585 en forma de pretzel.

Un retrato de Bendinelli sobrevive en una pintura votiva que donó a la iglesia de peregrinación en Aufkirchen, cerca de Starnberg, Baviera, después de un accidente de bote casi fatal en el Danubio en 1582.